Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ASF1BQ9NVP2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms