Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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