Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NSMCE2Q96MF7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms