Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C18orf8Q96DM3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms