Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCAMP4Q969E2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms