Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM41Q8WV44 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms