Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms