Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRCQ7RTU9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRCQ7RTU9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms