Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSH2Q76I76 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH2Q76I76 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms