Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM208BQ5VWN6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM208BQ5VWN6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM208BQ5VWN6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM208BQ5VWN6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM208BQ5VWN6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM208BQ5VWN6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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FAM208BQ5VWN6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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