Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BROXQ5VW32 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BROXQ5VW32 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms