Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMPD1Q5SYB0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms