Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHKAPQ2M3C7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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