Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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