Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD6Q15008 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms