Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SHPRHQ149N8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
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