Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HTR4Q13639 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms