Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNW1Q13573 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SNW1Q13573 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms