Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1orf61Q13536 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms