Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ATRQ13535 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ATRQ13535 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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