Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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TUBB3Q13509 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBB3Q13509 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBB3Q13509 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TUBB3Q13509 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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TUBB3Q13509 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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