Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABPAQ06546 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPAQ06546 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPAQ06546 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPAQ06546 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPAQ06546 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPAQ06546 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABPAQ06546 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms