Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms