Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN7AQ01118 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN7AQ01118 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms