Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MDM2Q00987 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MDM2Q00987 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms