Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms