Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UFM1P61960 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms