Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms