Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFRA1P56159 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms