Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMSP52788 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMSP52788 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMSP52788 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms