Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP3P42574 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP3P42574 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms