Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPOP42166 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPOP42166 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPOP42166 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms