Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 MLIP-209ENST00000509997 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 AC097376.2-203ENST00000608663 431 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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HOXD11P31277 CPO-201ENST00000272852 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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