Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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