Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLD1P28340 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLD1P28340 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms