Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMO2P25791 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMO2P25791 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LMO2P25791 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMO2P25791 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms