Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms