Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNNI3P19429 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNNI3P19429 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms