Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB1P11230 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms