Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GLI4P10075 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms