Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC166P0CW27 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC166P0CW27 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms