Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms