Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP9BO43861 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms