Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms