Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBAL3A6NHL2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms