Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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