Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PALM3A6NDB9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PALM3A6NDB9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms