Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PIPSLA2A3N6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms