Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAXBP1Q9Y5B6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms