Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM2AQ9Y2K7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms